Τελικά ο ίδιος άρχισε να σκέφτεται τη σύντμηση και η τελική απόφαση ελήφθη όταν τα δεκαοχτώ του γράμματα δεν χωρούσαν στην αφίσα τού «Στο τέλος του δρόμου», του Ντέρεκ Σιανφράνς: η επιλογή «M. Ali» δεν φαινόταν πολύ γοητευτική. Με τα πολλά, η κατάληξη στο «Μαχερσάλα Αλί» αντανακλούσε και κάτι βαθύτερο για τον 42χρονο ηθοποιό. «Νομίζω ότι αν επιθυμείς να γίνεις πρωταγωνιστής ή έστω να αφηγηθείς μια ιστορία, υπάρχει μια σχέση με το κοινό που πρέπει να καλλιεργηθεί» δήλωνε στο «Vanity Fair». «Πρέπει οι άνθρωποι να μπορούν να προφέρουν το όνομά σου».
Αυτές οι αναγνώσεις ήταν που του γέννησαν το ενδιαφέρον για τους μονολόγους, αν και εκείνη την περίοδο προείχε το μπάσκετ: οι επιδόσεις του τού χάρισαν μια υποτροφία στο St’ Mary’s College στην Καλιφόρνια, για σπουδές στην επικοινωνία. Ενα φοιτητικό ανέβασμα του μιούζικαλ «Spunk» τον απομάκρυνε από τα σπορ και κάπως έτσι βρέθηκε για μαθητεία στο California Shakespeare Theater. Ακολούθησε ένα μεταπτυχιακό στην υποκριτική στο Πανεπιστήμιο της Νέας Υόρκης, στο μεταξύ όμως είχαν συντελεστεί κι άλλες αλλαγές στη ζωή του. Από φοιτητής είχε αρχίσει να αμφισβητεί τη χριστιανική του ανατροφή. Μια μέρα, η συμφοιτήτριά του Αμάτους Καρίμ, του πρότεινε να την ακολουθήσει σε ένα τζαμί. Οταν αργότερα θα παντρεύονταν, ο Αλί είχε ήδη ασπαστεί το Ισλάμ.
Στην ταινία, που προβάλλεται στην Ελλάδα, ο Αλί υποδύεται ένα καλόκαρδο βαποράκι που παίρνει υπό την προστασία του τον νεαρό πρωταγωνιστή Σιρόν, ενώ εκείνος ανακαλύπτει τον ερωτικό του προσανατολισμό. Τον προστατεύει, τον ταΐζει, τον ενθαρρύνει να βρει την ταυτότητά του, μέχρι και κολύμπι του μαθαίνει. Οταν διάβασε το σενάριο, έλεγε στο «Vanity Fair» ο Αλί, δάκρυσε και αναφώνησε ότι είναι το καλύτερο που έχει κρατήσει στα χέρια του. Η ερμηνεία του τού χάρισε μια υποψηφιότητα για Οσκαρ δεύτερου ανδρικού ρόλου.
Ο ρόλος του ωστόσο στο «Moonlight» πέτυχε και κάτι άλλο εκτός από την ενίσχυση του βιογραφικού του: τον επανακαθορισμό των στερεοτύπων για τους Αφροαμερικανούς και την αρρενωπότητα. Σε συνέντευξή του στην «Guardian» ο Αλί δήλωνε ότι τα είχε υπόψη του αυτά και πως με τη συμμετοχή του στο «Moonlight» ένιωθε το βάρος της αντιπροσώπευσης μιας ολόκληρης κουλτούρας. «Πρέπει να έχεις επίγνωση για αυτά» έλεγε. «Καθώς προερχόμαστε από δεκαετίες ένταξης σε ένα πολύ στενό πλαίσιο, υπάρχει πολλή πίεση σε όσους απολαμβάνουν κάποιον βαθμό επιτυχίας, ώστε να αντικατοπτρίσουν κάθε τι θετικό από την κουλτούρα. Δεν ξέρω αν θα φύγει ποτέ αυτό. Νομίζω όμως ότι εξανεμίζεται όσο υπάρχει περισσότερη αντιπροσώπευση και περισσότερη ποικιλία στις ιστορίες».