Για υπόθεση λαθρεμπορίας καυσίμων είχε ελεγχθεί η πλοιοκτήτρια εταιρεία του «Αγία Ζώνη ΙΙ» το 2012 και το 2013. Σύμφωνα με τον αρχηγό του Λιμενικού Σώματος Σταμάτη Ράπτη, η εταιρεία τελικώς απηλλάγη με βούλευμα.

Ο αρχηγός επεσήμανε ότι ο πλοιοκτήτης Θοδωρής Κουντούρης είναι παράλληλα έμπορος και διανομέας πετρελαίου και ότι το μαζούτ που βρισκόταν στις δεξαμενές του πλοίου προοριζόταν για τον ανεφοδιασμό τεσσάρων πλοίων μεταφοράς εμπορευματοκιβωτίων και ενός motor vessel.