Ποινική δίωξη για σειρά κακουργηματικών πράξεων για την υπόθεση της κακοδιαχείρισης της ΑΕΠΙ άσκησε ο εισαγγελέας πρωτοδικών Γιάννης Παναγόπουλος, ο οποίος διενήργησε την προκαταρκτική εξέταση
Η δίωξη περιλαμβάνει τα εξής αδικήματα :
1)Συγκρότηση και ένταξη σε εγκληματική οργάνωση.
2) Κακουργηματική υπεξαίρεση από κοινού από εντολοδόχο.
3)Κακουργηματική απάτη από κοινού κατ΄επάγγελμα
4)Kακουργηματική απιστία από κοινού
5)Nομιμοποίηση εσόδων από παράνομες δραστηριότητες κατ΄επάγγελμα
6)Kακουργηματική ανακριβής απόδοση ΦΠA και
7)Kακουργηματική φοροδιαφυγή δια της ανακριβούς απόδοσης φόρου.
Η εισαγγελία Πρωτοδικών είχε σχηματίσει δικογραφία για την υπόθεση, μετά την άρνηση της ΑΕΠΙ να δεχθεί διαχειριστικό έλεγχο, ζητώντας από τη ΦΑΕ Αθηνών την διενέργεια φορολογικού ελέγχου για τις χρήσεις 2010-2015.
Η περαιτέρω διερεύνηση της υπόθεσης ανατέθηκε σε ανακριτή, ενώπιον του οποίου τα εμπλεκόμενα πρόσωπα θα κληθούν να δώσουν τις αναγκαίες εξηγήσεις.